안녕하세요, C 파일 다운로드

. hic 파일 형식은 광범위 하 게 및 shamim 외 알., 2016에 설명 되어 있습니다. 당신은이 테이블에 보충 물자에서 정확한 명세를 얻기 위하여 볼 수 있다, 또는이 문서에. 이는. hic 파일에서 매트릭스를 추출 하 고 스파스 위쪽 삼각 행렬 형식으로 K562 22.500 kb 텍스트 파일에 저장 합니다. https://github.com/theaidenlab/straw/wiki/CPP#running에서 빨 대를 사용 하는 방법에 대 한 자세한 예제를 참조 하십시오. 밀 짚은 여러 개의 입력을 필요로 합니다. 과즙 짜는 기구 데이터 아카이브 aidenlab.org/data.html에서 사용할 수 있으며, hic 파일, 아래에 설명 되어있습니다. 3install 파일을 열고 원하는 곳에 응용 프로그램을 배치 합니다. 처음 시작 자바 자동으로 자체를 설치할 수 있습니다. 이것은 단지 몇 분 지난 것입니다.

이것은 .hic 파일에 프로그램으로 접근을 위한 파일 chrX_norm에 5 킬로바이트 해상도에서 염색체 X의 VC 정규화 벡터를 덤프 합니다, 밀 짚, 우리는 나열 된 트랙 파일을 사용 합니다 다음 음모에 우리의 빠른 데이터 추출 소프트웨어를 참조 하십시오. 이를 추적 .ini로 저장 하십시오. 도구 및. hic 파일 형식의 과즙 짜는 기구/juicebox 제품군은 aiden 연구소 웹사이트에 설명 되어 있습니다. 과즙 짜는 기구 파이프라인 fastq 파일을 입력으로 취하고 여러 해상도에서 정규화 된 연락처 매트릭스를 포함 하는. hic 파일을 만들고, 도메인 및 루프를 호출 합니다. juicebox 도구는. hic 파일을 읽고 시각화 및 고급 사용자 지정 다운스트림 분석을 제공 합니다.

. hic 파일을 만들려면, 사용자 fastq 파일을 시작할 수 있으며, 전체 과즙 짜는 기구를 실행 하거나 유효한 읽기 쌍 inter묵상 텍스트 파일과 함께 시작, merged_nodups „예약” 형식입니다. 고급 사용자의 경우 여기에서. hic 파일 스키마를 사용할 수 있습니다. 여기서 당신은 각 염색체를 위한 상호 작용 행렬을 포함 하 여 자료의 각종 양상, 및 우리의 분석에 의해 확인 된 도메인의 위치를 다운로드할 수 있다. 원시 데이터를 시퀀싱 하 고 매핑된 읽기를 다운로드 하려면, 지리적 가입 번호 GSE35156 루프 및 도메인에 대 한 아래 지 오 데이터베이스를 방문 하십시오, 특정 url에서 작업을 덤프 하 고 단순히 도메인과 루프 파일을 url과 관련 된 덤프를 찾습니다. 출력으로 우리는 경계, 도메인 및 점수 구분 된 파일을 얻을. 우리는 단지 태 드-점수 파일 아래에 있는 줄거리에서 사용 합니다. 4dn 컨소시엄은 처리 되며 4dn 데이터 포털을 통해 과학 커뮤니티에 제공 하는 하이-C 데이터를 많이 생성 됩니다.